Mon doctorat en chimie à l'Université de Genève, puis mes années de recherche, m'ont amené à explorer des univers très différents : synthèse organique, chimie supramoléculaire, chimie analytique, produits naturels, toxicologie, peptides et protéines, interactions entre chimie et biologie.

Chaque domaine possède son vocabulaire, ses méthodes et sa manière d'aborder un problème. Mes publications témoignent de cette diversité.

Mais cette diversité m'a surtout appris quelque chose qui dépasse largement la chimie : un problème complexe se comprend rarement à travers une seule expertise ou un seul point de vue.

Avec le temps, j'ai appris à passer d'un langage à l'autre, à comprendre ce que chacun apporte et à créer des liens entre des perspectives différentes.

Cette expérience a profondément façonné ma manière de communiquer et de travailler.

Comprendre avant de conclure.
Relier les connaissances, les personnes et les points de vue.
Agir en transformant cette compréhension en quelque chose de concret.

C'est cette même logique qui m'accompagne aujourd'hui dans PK Strategy.

Des sujets différents, une même démarche

Mes années de recherche m'ont conduit à travailler sur des sujets parfois très éloignés en apparence. De la synthèse de nouvelles molécules aux architectures supramoléculaires, de l'identification d'une substance psychoactive aux molécules issues du monde végétal, des interactions entre bactéries et plantes aux modifications chimiques de peptides et de protéines, chaque projet m'a confronté à une nouvelle problématique et souvent à un nouveau langage scientifique. 

Derrière cette diversité, je retrouve aujourd'hui un même fil conducteur :

observer un problème sous plusieurs angles, confronter les informations et créer les connexions nécessaires pour parvenir à une compréhension plus complète.

Des expertises différentes, un objectif commun

La recherche m'a également appris qu'un problème complexe se résout rarement seul ou avec une seule expertise.

Au fil des projets, j'ai travaillé avec des spécialistes issus de disciplines différentes. Chacun observait le problème avec son propre regard, son vocabulaire, ses méthodes et ses priorités. Cette dimension a pris une autre ampleur durant mes années chez CAS. J'ai régulièrement eu l'occasion de faire des présentations et de donner des formations, en Suisse, dans différents pays d'Europe et au Maghreb, auprès de publics aux profils et aux attentes variés. Il ne suffisait plus de connaitre un sujet. Il fallait comprendre à qui je m'adressais, ce que cette personne cherchait à accomplir, son contexte professionnel et le niveau d'information dont elle avait réellement besoin.

Scientifiques, spécialistes de l'information, utilisateurs de technologies ou décideurs pouvaient s'intéresser au même sujet, mais pas nécessairement avec les mêmes questions, les mêmes priorités ni le même vocabulaire. Les différences de contextes et de cultures professionnelles ajoutaient une autre dimension.

J'ai ainsi appris qu'expliquer ne consiste pas simplement à transmettre une information. Il faut savoir écouter, comprendre le point de vue de l'autre et trouver le langage qui crée une compréhension commune.

C'est progressivement devenu une conviction :

Nous parlons souvent de la même chose, mais dans des langues différentes.

Savoir passer d'un langage à l'autre, relier les expertises et rendre une information complexe compréhensible sans la dénaturer est devenu une part essentielle de ma manière de travailler.

RECHERCHE ET PUBLICATIONS SCIENTIFIQUES

Ces travaux ont été réalisés entre 1992 et 1999, pendant mes années de recherche.

Je les présente ici non comme des travaux récents, mais comme les traces d'une période qui a profondément contribué à construire ma manière de réfléchir, d'analyser et de communiquer.

1997 · Doctorat en chimie
Détermination de structures organiques par la résonance magnétique nucléaire à séquences d'impulsions complexes à 9.4 et 14.1 teslas

Université de Genève · Faculté des sciences · Thèse n° 2878

Philippe Kamalaprija

Cette thèse explore la RMN à l'interface entre chimie, physique et informatique, à travers des problématiques allant de la détermination de structures à la dynamique moléculaire et à la chimie supramoléculaire.

Publications scientifiques

1999 · Peptides et protéines

New cyclization reaction at the amino terminus of peptides and proteins

Bioconjugate Chemistry, 10(6), 1038-1043

Keith Rose, Jianhua Chen, Marina Dragovic, Weiguang Zeng, Damien Jeannerat, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger

L'oxydation de certains peptides et protéines portant une sérine ou une thréonine en position N-terminale permet normalement de former un aldéhyde utilisable pour la bioconjugaison. L'étude montre que, lorsqu'une proline suit cette position, une réaction rapide de cyclisation peut se produire. Le produit formé a été caractérisé par spectrométrie de masse et RMN, et une méthode permettant néanmoins d'obtenir efficacement la conjugaison recherchée a été démontrée. 

DOI : 10.1021/bc9900587

1998 · Toxicologie analytique

2C-B: a new psychoactive phenylethylamine recently discovered in Ecstasy tablets sold on the Swiss black market

Journal of Analytical Toxicology, 22(5), 345-354

C. Giroud, M. Augsburger, L. Rivier, P. Mangin, F. Sadeghipour, E. Varesio, J. L. Veuthey, P. Kamalaprija

Cette étude porte sur l'identification du 2C-B découvert dans deux séries de comprimés provenant du marché noir suisse. Plusieurs méthodes analytiques ont été utilisées. L'identification sans ambiguïté du 2C-B n'a été obtenue qu'en combinant spectrométrie de masse et RMN. Les comprimés analysés contenaient entre 3 et 8 mg de 2C-B. 

DOI : 10.1093/jat/22.5.345

1998 · Interactions plantes-bactéries

nolO and noeI (HsnIII) of Rhizobium sp. NGR234 are involved in 3-O-carbamoylation and 2-O-methylation of Nod factors

Journal of Biological Chemistry, 273(20), 12047-12055

Said Jabbouri, Biserka Relic, Moez Hanin, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger, Danielle Prome, Jean Claude Prome, William J. Broughton

Cette étude examine certains gènes impliqués dans les modifications chimiques des facteurs Nod produits par Rhizobium sp. NGR234. Les analyses montrent notamment que nolO et noeI sont nécessaires à deux modifications spécifiques de ces molécules. Le transfert de nolO à une autre souche de Rhizobium a également étendu sa gamme de plantes hôtes. 

DOI : 10.1074/jbc.273.20.12047

1997 · Chimie supramoléculaire

Reaction cascade in the supramolecular phosphorylation of a bis(guanidinium) diol

Tetrahedron Letters, 38(17), 2923-2926

Marc-Steffen Muche, Philippe Kamalaprija, Michael W. Gobel

Une réaction de phosphorylation supramoléculaire a été suivie par RMN du phosphore. Une succession de transferts rapides de phosphate a été observée, avec des vitesses supérieures de quatre à cinq ordres de grandeur à celles d'une réaction de contrôle. Cette accélération est liée notamment à la proximité des partenaires de réaction au sein du système supramoléculaire. 

DOI : 10.1016/S0040-4039(97)00513-3

1997 · Complexes métalliques

A Comparison of the Lability of Mononuclear Octahedral and Dinuclear Triple-Helical Complexes of Cobalt(II)

Journal of the American Chemical Society, 119(10), 2488-2496

Loiec J. Charbonniere, Alan F. Williams, Urban Frey, Andre E. Merbach, Philippe Kamalaprija, Olivier Schaad

Cette étude compare la dynamique d'un complexe mononucléaire de cobalt et celle d'un complexe dinucléaire organisé en triple hélice. La racémisation de la triple hélice est environ 100 000 fois plus lente. L'étude établit également un mécanisme de formation de cette triple hélice et relie sa grande inertie à la rigidité du ligand et à la géométrie serrée de l'hélice. 

DOI : 10.1021/JA963693L

1996 · Chimie organique

Acid-catalyzed backbone rearrangement of cholesta-6,8(14)-dienes

Helvetica Chimica Acta, 79(4), 989-998

Rong Ming Liu, Xavier F. D. Chillier, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger, Fazil O. Guelacar

L'étude décrit le réarrangement de cholesta-6,8(14)-diènes en milieu acide vers de nouvelles structures de type abeo-cholestadiène. Des calculs de mécanique moléculaire sur la stabilité relative des composés sont en accord avec le chemin réactionnel observé expérimentalement. 

DOI : 10.1002/hlca.19960790407

1995 · Interactions plantes-bactéries

Involvement of nodS in N-methylation and nodU in 6-O-carbamoylation of Rhizobium sp. NGR234 nod factors

Journal of Biological Chemistry, 270(39), 22968-22973

Said Jabbouri, Remy Fellay, Franck Talmont, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger, Biserka Relic, Jean-Claude Prome, William J. Broughton

Cette étude analyse le rôle des gènes nodS et nodU dans les modifications structurales des facteurs Nod de Rhizobium sp. NGR234. Les résultats montrent notamment l'implication de nodS dans la N-méthylation et de nodU dans la 6-O-carbamoylation de ces molécules.

DOI : 10.1074/jbc.270.39.22968

1995 · Produits naturels

Iridoid diester from Valeriana officinalis sambucifolia hairy roots

Phytochemistry, 38(1), 103-105

Francois Graenicher, Philippe Christen, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger

Un nouveau composé, nommé valdiate, a été isolé à partir de racines transformées de Valeriana officinalis sambucifolia et caractérisé à partir de ses propriétés chimiques et physiques. Cinq valépotriates ont également été isolés et identifiés par spectrométrie de masse et RMN. Le valdiate n'a pas été retrouvé dans les racines non transformées de la même espèce. 

DOI : 10.1016/0031-9422(95)91889-9

1993 · Recherche antipaludique

Cyclopenteno-1,2,4-trioxanes as effective antimalarial surrogates of artemisinin

Perspectives in Medicinal Chemistry, 459-472

Charles W. Jefford, Dharmendra Misra, Jean Claude Rossier, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger, Jiri Mareda, Gerald Bernardinelli, Wallace Peters, Brian L. Robinson, et al.

Des cyclopenténo-1,2,4-trioxanes ont été étudiés comme analogues de l'artémisinine pour leur activité antipaludique. Plusieurs composés se sont révélés actifs, avec de meilleurs résultats pour certaines structures spirocycliques. La présence de substituants oxygénés améliorait également l'activité. 

1992 · Synthèse organique

Synthesis of 1,2-dioxanes from an endoperoxide

Tetrahedron Letters, 33(47), 7129-7132

Charles W. Jeffort, Shu Juan Jin, Philippe Kamalaprija, Ulrich Burger, Gerald Bernardinelli

Cette étude décrit une réaction permettant d'obtenir des 1,2-dioxanes à partir d'un endoperoxyde. La structure d'un des produits a été déterminée par diffraction des rayons X. Le principe de cette réaction pouvait également être appliqué à la synthèse de précurseurs de prostaglandines. 

DE LA SCIENCE A L'ACTION

Ces publications appartiennent à une période particulière de mon parcours. Mais la manière de penser qu'elles ont contribué à construire est toujours présente.

Le doctorat et la recherche m'ont appris la rigueur et la nécessité de confronter les hypothèses aux faits.

La diversité des projets m'a appris à changer de perspective et à créer des liens entre des domaines différents.

Mes années chez CAS, les présentations, les formations et les rencontres avec des professionnels aux profils et aux contextes différents m'ont appris à adapter le langage sans perdre la substance.

Aujourd'hui, les sujets ont changé, mais cette manière de travailler reste la même.

UNDERSTAND · CONNECT · ACT

Comprendre le problème.

Relier les connaissances, les personnes et les perspectives.

Transformer cette compréhension en action.

C'est le lien entre mon parcours scientifique, mes années d'expérience professionnelle et ce que je fais aujourd'hui avec PK Strategy.